病理性TDP-43作为诊断TDP-43蛋白病的生物标志物

本公开涉及抗体或其抗原结合片段以及包含它们的组合物。本公开还涉及使用本文描述的抗体或其抗原结合片段检测生物样品中的tar dna结合蛋白43(tdp-43)、在受试者中诊断神经变性疾病以及选择是否将受试者纳入具有tdp-43包含物的额颞叶变性(ftld-tdp)的临床试验的方法。此外，本公开涉及用于选择性检测生物样品中的tdp-43的免疫测定试剂盒。背景技术：1、人口正在老龄化，并且神经变性疾病正在成为一个日益增长和棘手的健康挑战。尽管阿兹海默氏病(ad)是痴呆症的最常见病因，但额颞叶痴呆症(ftd)在65岁以下人群中第二常见。ftd是一种非均质性神经变性疾病，其特征在于进行性行为和/或语言障碍，包括一系列临床亚型，例如行为变异性ftd、进行性非流利性失语症和语义性痴呆。在病理学上，大多数患者具有额颞叶变性(ftld)。这些患者中约有一半显示出过度磷酸化的tau蛋白的积累(在一种被称为ftld-tau的亚型中)，而大多数其他患者表现出反式激活dna结合蛋白tdp-43的积累(ftld-tdp亚型)。然而，这些临床病症也可能由ad的异常表现引起。由于不同的潜在病理需要特定的治疗干预，因此迫切需要稳健的生物标志物以根据个体患者的特定潜在分子病理(即ftld-tau、ftld-tdp或ad)为其正确选择适合的药物。尽管ad存在标志性脑脊液(csf)标志物(低aβ42以及高t-tau和p-tau)，但目前既没有可靠的结构/功能成像方法，也没有基于csf/血清液体生物标志物的方法可用于诊断ftld-tau或ftld-tdp。2、因此，对鉴定用于诊断ftld-tdp的稳健血浆生物标志物以及用于检测和定量所述生物标志物的高度灵敏和特异的免疫测定法，存在着需求。技术实现思路1、一方面，本公开涉及一种抗体或其抗原结合片段，其包含免疫球蛋白重链(hc)可变结构域序列和免疫球蛋白轻链(lc)可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seq id no：4的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq idno：5的氨基酸序列，和(iii)hc cdr3，其包含seq id no：6的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq id no：8的氨基酸序列，(ii)lccdr2，其包含seq id no：9的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：10的氨基酸序列。在一个实施方式中，所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含seq id no：3的氨基酸序列；并且所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含seq id no：7的氨基酸序列。2、另一方面，本公开涉及一种抗体或其抗原结合片段，其包含免疫球蛋白重链(hc)可变结构域序列和免疫球蛋白轻链(lc)可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seq id no：12的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seqid no：13的氨基酸序列，和(iii)hc cdr3，其包含seq id no：14的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq id no：16的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seq id no：17的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：18的氨基酸序列。在一个实施方式中，所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含seq id no：11的氨基酸序列；并且所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含seq id no：15的氨基酸序列。3、本公开的另一方面提供了一种抗体或其抗原结合片段，其包含免疫球蛋白重链(hc)可变结构域序列和免疫球蛋白轻链(lc)可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seq id no：20的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq id no：21的氨基酸序列，和(iii)hc cdr3，其包含seq id no：22的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq id no：24的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seq id no：25的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：26的氨基酸序列。在一个实施方式中，所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含seq id no：19的氨基酸序列；并且所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含seq id no：23的氨基酸序列。在另一个实施方式中，所述免疫球蛋白重链可变区和所述免疫球蛋白轻链可变区一起结合tar dna结合蛋白43(tdp-43；seq id no：1)的至少一部分。在另一个实施方式中，所述免疫球蛋白重链可变区和所述免疫球蛋白轻链可变区一起结合seq id no：2的至少一部分。4、本公开的另一方面提供了一种分离的核酸，其包含编码本文所描述的抗体或其抗原结合片段的核苷酸序列。5、本公开的另一方面提供了本文所描述的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者的用途，其用于预筛选临床试验的受试者。6、本公开的另一方面提供了一种免疫测定法，其包含本文所描述的抗体或其抗原结合片段中的一者或多者。7、本公开的另一方面提供了一种检测生物样品中的tar dna结合蛋白43(tdp-43；seq id no：1)的方法，所述方法包括：将所述样品与抗体或其抗原结合片段接触，其中所述抗体或抗原结合片段包含免疫球蛋白重链(hc)可变结构域序列和免疫球蛋白轻链(lc)可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seqid no：4的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq id no：5的氨基酸序列，和(iii)hc cdr3，其包含seq id no：6的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lccdr1，其包含seq id no：8的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seq id no：9的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：10的氨基酸序列。在一个实施方式中，所述方法进一步包括将所述样品与第二抗体或其抗原结合片段接触，其中所述第二抗体或抗原结合片段包含免疫球蛋白hc可变结构域序列和免疫球蛋白lc可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seq id no：12的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq id no：13的氨基酸序列，和(iii)hc cdr3，其包含seq id no：14的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq id no：16的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seq id no：17的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq idno：18的氨基酸序列。在另一个实施方式中，所述方法进一步包括将所述样品与第二抗体或其抗原结合片段接触，其中所述第二抗体或抗原结合片段包含免疫球蛋白hc可变结构域序列和免疫球蛋白lc可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seq id no：20的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq id no：21的氨基酸序列，和(iii)hc cdr3，其包含seq id no：22的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq id no：24的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seq id no：25的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：26的氨基酸序列。在另一个实施方式中，所述tdp-43是错误折叠的。在另一个实施方式中，所述样品包括细胞或组织样品。在另一个实施方式中，所述样品包括血浆、血清或脑脊液(csf)。在另一个实施方式中，所述样品从被诊断为患有、疑似患有神经变性疾病或具有患有或发生神经变性疾病的风险的受试者获得。在另一个实施方式中，所述神经变性疾病是额颞叶变性(ftld)。在另一个实施方式中，所述检测包括免疫组织化学(ihc)、中尺度发现(msd)生物标志物测定、western印迹、流式细胞术、放射免疫测定(ria)、计数免疫测定(cia)、酶免疫测定(eia)或酶联免疫吸附测定(elisa)、荧光免疫测定(fia)或化学发光免疫测定(clia)中的一者或多者。8、本公开的另一方面提供了一种在受试者中诊断神经变性疾病的方法，所述方法包括检测来自所述受试者的生物样品中tar dna结合蛋白43(tdp-43；seq id no：1)的存在，所述方法包括：将所述样品与抗体或其抗原结合片段接触，其中所述抗体或抗原结合片段包含免疫球蛋白重链(hc)可变结构域序列和免疫球蛋白轻链(lc)可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seq id no：4的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq id no：5的氨基酸序列，和(iii)hc cdr3，其包含seq id no：6的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq idno：8的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seq id no：9的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：10的氨基酸序列；其中tdp-43的存在指示所述受试者患有神经变性疾病。在一个实施方式中，所述方法进一步包括将所述样品与第二抗体或其抗原结合片段接触，其中所述第二抗体或抗原结合片段包含免疫球蛋白hc可变结构域序列和免疫球蛋白lc可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seqid no：12的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq id no：13的氨基酸序列，和(iii)hccdr3，其包含seq id no：14的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq id no：16的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seq id no：17的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：18的氨基酸序列。在另一个实施方式中，所述方法进一步包括将所述样品与第二抗体或其抗原结合片段接触，其中所述第二抗体或抗原结合片段包含免疫球蛋白hc可变结构域序列和免疫球蛋白lc可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seq id no：20的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq id no：21的氨基酸序列，和(iii)hc cdr3，其包含seq id no：22的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq idno：24的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seq id no：25的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：26的氨基酸序列。在另一个实施方式中，所述神经变性疾病是额颞叶变性(ftld)。9、本公开的另一方面提供了一种用于选择性检测生物样品中的tar dna结合蛋白43(tdp-43；seq id no：1)的免疫测定试剂盒，所述试剂盒包含：抗体或其抗原结合片段，其中所述抗体或抗原结合片段包含免疫球蛋白重链(hc)可变结构域序列和免疫球蛋白轻链(lc)可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seq id no：4的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq id no：5的氨基酸序列，和(iii)hccdr3，其包含seq id no：6的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq id no：8的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seq id no：9的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：10的氨基酸序列；以及检测试剂。在一个实施方式中，所述试剂盒进一步包含用于所述抗体或其抗原结合片段的固相支持物。在另一个实施方式中，所述试剂盒进一步包含检测工具。在另一个实施方式中，所述检测工具是荧光、发光、放射活性和比色中的一者或多者。在另一个实施方式中，所述检测试剂是比色底物、化学发光底物和荧光底物中的一者或多者。在另一个实施方式中，包含第二抗体或其抗原结合片段，其中所述第二抗体或抗原结合片段包含免疫球蛋白hc可变结构域序列和免疫球蛋白lc可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seq id no：12的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq id no：13的氨基酸序列，和(iii)hc cdr3，其包含seq id no：14的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq id no：16的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seq idno：17的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：18的氨基酸序列。在另一个实施方式中，所述试剂盒进一步包含第二抗体或其抗原结合片段，其中所述第二抗体或抗原结合片段包含免疫球蛋白hc可变结构域序列和免疫球蛋白lc可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seq id no：20的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq id no：21的氨基酸序列，和(iii)hc cdr3，其包含seq id no：22的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq id no：24的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seq id no：25的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：26的氨基酸序列。10、本公开的另一方面提供了一种选择是否将受试者纳入具有tar dna结合蛋白43包含物的额颞叶变性(ftld-tdp)的临床试验的方法，所述方法包括：(a)测量来自所述受试者的样品中tar dna结合蛋白43(tdp-43；seq id no：1)的表达水平，其中所述测量包括将所述样品与抗体或其抗原结合片段接触，其中所述抗体或抗原结合片段包含免疫球蛋白重链(hc)可变结构域序列和免疫球蛋白轻链(lc)可变结构域序列，其中：(a1)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(a1a)hc cdr1，其包含seq id no：4的氨基酸序列，(a1b)hc cdr2，其包含seq id no：5的氨基酸序列，和(a1c)hc cdr3，其包含seq id no：6的氨基酸序列；并且(a2)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(a2a)lc cdr1，其包含seq id no：8的氨基酸序列，(a2b)lc cdr2，其包含seq id no：9的氨基酸序列，和(a2c)lc cdr3，其包含seq idno：10的氨基酸序列；(b)将所述tdp-43的表达水平与阈值表达水平进行比较；并且其中：(b1)如果所述tdp-43的表达水平高于所述阈值表达水平，则选择所述受试者进行所述临床试验；或者(b2)如果所述tdp-43的表达水平低于所述阈值表达水平，则不选择所述受试者进行所述临床试验。在一个实施方式中，所述测量进一步包括将所述样品与第二抗体或其抗原结合片段接触，其中所述第二抗体或抗原结合片段包含免疫球蛋白hc可变结构域序列和免疫球蛋白lc可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hccdr1，其包含seq id no：12的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq id no：13的氨基酸序列，和(iii)hc cdr3，其包含seq id no：14的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq id no：16的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seqid no：17的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：18的氨基酸序列。在另一个实施方式中，所述测量进一步包括将所述样品与第二抗体或其抗原结合片段接触，其中所述第二抗体或抗原结合片段包含免疫球蛋白hc可变结构域序列和免疫球蛋白lc可变结构域序列，其中：(a)所述免疫球蛋白hc可变结构域序列包含(i)hc cdr1，其包含seq id no：20的氨基酸序列，(ii)hc cdr2，其包含seq id no：21的氨基酸序列，和(iii)hc cdr3，其包含seq id no：22的氨基酸序列；并且(b)所述免疫球蛋白lc可变结构域序列包含(i)lc cdr1，其包含seq id no：24的氨基酸序列，(ii)lc cdr2，其包含seq id no：25的氨基酸序列，和(iii)lc cdr3，其包含seq id no：26的氨基酸序列。11、本公开提供了根据下面的详细描述和附图将显而易见的其他方面和实施方式。