一种以非洲猪瘟病毒E165R蛋白为靶点的小分子化合
发布日期:2024-08-22 浏览次数: 专利申请、商标注册、软件著作权、资质办理快速响应热线:4006-054-001 微信:15998557370
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摘要: | 本发明属于抗病毒药物领域,具体涉及一种以非洲猪瘟病毒er蛋白为靶点的小分子化合物z在制备抗非洲猪瘟病毒药物中的应用。、非洲猪瘟(african swine fever, asf)是由非洲猪瘟病毒(asfv)感染引起的一种以猪发热和全身脏器出血为特征的急性烈性传染病。非洲猪瘟是世界动物卫生组... | ||
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本发明属于抗病毒药物领域,具体涉及一种以非洲猪瘟病毒e165r蛋白为靶点的小分子化合物z3015156820在制备抗非洲猪瘟病毒药物中的应用。背景技术:1、非洲猪瘟(african swine fever, asf)是由非洲猪瘟病毒(asfv)感染引起的一种以猪发热和全身脏器出血为特征的急性烈性传染病。非洲猪瘟是世界动物卫生组织(oie)要求法定报告动物疫病。我国动物病原微生物名录将其列为一类病。2、asf于20世纪50年代传入欧洲,整个欧洲用了40年消除该病。然而,该病自2007年再次从东非传入格鲁吉亚,并迅速扩散至东欧国家,并于2017年传入俄罗斯远东地区。2018年8月,非洲猪瘟在我国沈阳首次发现,短短一年内,该病蔓延至全国30个省市自治区,给我国养猪业带来了巨大打击。由于至今仍无疫苗和特效治疗药物,非洲猪瘟疫情一旦发生,只能通过扑杀手段进行控制,但是这种方式不仅导致经济损失,而且无法满足我国规模化养猪的需要。因此,如何有效控制asf疫情是目前世界养猪业面临的巨大挑战之一,也是我国asf防控急需解决的重大难题。3、e165r蛋白是由asfv编码的,发挥三磷酸脱氧尿苷酶(dutpase)功能的非结构蛋白,该蛋白能有效降低脱氧尿苷浓度并为胸腺苷合成酶提供底物,进而确保病毒复制过程中dna的完整性。由于dutpase主要存在于活跃分裂和分化的细胞中,而asfv主要感染的猪巨噬细胞是静息细胞并没有dutpase。因此,asfv必须依赖自身编码的 e165r来保证在猪巨噬细胞内的正常复制。e165r蛋白是一种同源三聚体dutpase,包含五个高度保守的基序,这些基序表现出具有特定焦磷酸酶活性的活性酶促位点。除此之外,e165r还含有独特的双亚基活性位点,对高温具有极高的耐受性。细胞高通量筛选是寻找抗asfv药物的常见手段。该方法虽然准确率高,但成本较为昂贵,且筛选出的化合物靶向机制不明确,可能对宿主蛋白具有副作用。直接靶向病毒的化合物往往是病毒特异性的,主要通过直接作用于病毒蛋白或病毒基因组来发挥抗病毒效果。但目前针对非洲猪瘟病毒e165r蛋白的药物研究并不常见。有文献报道,根据asfv e165r蛋白的活性位点设计的化合物,在细胞水平上抑制asfv复制效果并不理想。因此,寻找可在细胞上抑制asfv复制的靶向e165r的化合物更具有意义。 技术实现思路1、针对现有技术中所存在的问题,本发明的目的在于提供一种以非洲猪瘟病毒e165r蛋白为靶点的小分子化合物z3015156820(iupac名称:3-[2-(2-tert-butylphenoxy)pyridin-3-yl]-1-[5-(4-phenyl-4h-1,2,4-triazol-3-yl)pyridin-2-yl]urea)在制备抗非洲猪瘟病毒药物中的应用。本发明利用计算机辅助药物设计中的虚拟筛选技术,针对asfv e165r蛋白晶体结构的解析,筛选到与靶标蛋白具有潜在抑制作用的小分子化合物。利用人工表达的asfv e165r蛋白,借助表面等离子共振实验(spr)鉴定小分子化合物与靶蛋白的亲和力常数;通过cck-8试剂盒检验小分子化合物z3015156820的细胞毒性;借助荧光定量pcr、免疫荧光实验及western blot实验检测其抑制病毒感染的活性,结果表明可显著抑制asfv的感染。2、为了实现上述目的及其他相关目的,本发明采用如下技术方案:3、本发明的第一方面,提供一种以非洲猪瘟病毒e165r蛋白为靶点的小分子化合物z3015156820在制备抗非洲猪瘟病毒药物中的应用,该小分子化合物z3015156820是从enamine advanced药物数据库中筛选出的小分子化合物,分子量505.57,分子式是c29h27n7o2,分子结构式为:4、。5、本发明的第二方面,提供了前述小分子化合物z3015156820的筛选方法是,以蛋白质结构库中非洲猪瘟病毒e165r(pdb id: 6lj3)作为对接受体,autodock vina软件对enamine advanced药物数据库中448388个化合物进行筛选的具体步骤如下:整合enamineadvanced数据库化合物格式;根据e165r活性位点设置盒子(box)中心位置(x轴:-9.695,y轴:14.741,z轴:-7.291),盒子大小设置为26 å×26 å×26 å;去除e165r水分子、配体等,将结构导入结合位点文件,在autodock vina软件下进行对接,筛选e165r抑制剂。6、本发明的第三方面,提供了一种虚拟筛选后,利用表面等离子共振技术对e165r抑制剂进行第二轮筛选验证的方法,方法是利用biacore技术分析小分子化合物与偶联于传感器芯片的重组asfv e165r蛋白之间的结合情况,证明小分子化合物z423747092可直接与偶联在芯片上的e165r结合,亲和力较高。7、本发明的第四方面,提供了小分子化合物z3015156820在制备抗非洲猪瘟病毒药物中的应用。8、在一些优选的实施方案中所述抗非洲猪瘟病毒药物可以为片剂、喷雾剂、颗粒剂、胶囊剂、口服液、针剂、混悬液的任一种。9、进一步地,所述非洲猪瘟病毒为基因ⅱ型非洲猪瘟病毒。10、进一步地,所述小分子化合物的浓度为12.5~200 μm。11、进一步地,所述小分子化合物的浓度为12.5~200 μm。12、进一步地,所述小分子化合物用于抑制非洲猪瘟病毒感染的活性。13、进一步地,所述小分子化合物用于抑制asfv p30、p72及e165r蛋白的表达。14、进一步地,编码所述e165r蛋白的引物序列如seq id no:1和seq id no:2所示。15、进一步地,所述药物还包括药学上可接受的载体。16、进一步地,所述药学上可接受的载体包括赋形剂、助流剂、稀释剂、防腐剂、着色剂、矫味剂、润湿剂、助悬剂、稳定剂、等渗剂、溶剂、乳化剂中的至少一种。17、进一步地,所述药物还包括赋形剂,所述赋形剂选自固体赋形剂、液体或半固体赋形剂。18、有益效果19、本发明基于asfv e165r蛋白晶体结构,通过虚拟筛选技术,获得了与asfv e165r特异性结合的小分子化合物z3015156820。通过表面等离子共振检测,化合物z3015156820与asfv e165r具备较高的亲和力。所述小分子化合物在细胞水平上病毒抑制效果显著。进一步通过后续体外活性实验,对所述小分子化合物进行进一步的生物活性验证,结果表明,小分子化合物z3015156820在12.5~200 μm浓度下均对asfv有显著抑制作用,且对感染pam细胞的asfv p30、p72及e165r蛋白表达具有显著抑制效果。技术特征:1.一种以非洲猪瘟病毒e165r蛋白为靶点的小分子化合物在制备抗非洲猪瘟病毒药物中的应用,所述的小分子化合物分子式是c29h27n7o2,结构式为:2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述非洲猪瘟病毒为基因ⅱ型非洲猪瘟病毒。3. 根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述小分子化合物的浓度为12.5~200 μm。4. 根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述小分子化合物的浓度为12.5~200 μm。5.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述小分子化合物用于抑制非洲猪瘟病毒感染的活性。6. 根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述小分子化合物用于抑制asfv p30、p72及e165r蛋白的表达。7.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述药物还包括药学上可接受的载体。8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,所述药学上可接受的载体包括赋形剂、助流剂、稀释剂、防腐剂、着色剂、矫味剂、润湿剂、助悬剂、稳定剂、等渗剂、溶剂、乳化剂中的至少一种。9.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述药物的剂型选自片剂、喷雾剂、颗粒剂、胶囊剂、口服液、针剂、混悬液的任一种。10. 根据权利要求1所述的应用,其特征在于,编码所述e165r蛋白的引物序列如seqid no:1和seq id no:2所示。技术总结本发明属于抗病毒药物领域,公开了一种以非洲猪瘟病毒E165R蛋白为靶点的小分子化合物的应用。本发明利用人工表达的ASFV E165R蛋白,借助表面等离子共振实验(SPR)鉴定小分子化合物与靶蛋白的亲和力常数;通过CCK‑8试剂盒检验小分子化合物Z3015156820的细胞毒性;借助荧光定量PCR、免疫荧光实验及Western blot实验检测其抑制病毒感染的活性,结果表明可显著抑制ASFV的感染。技术研发人员:焦新安,潘志明,黄霞,康喜龙,孟闯,顾丹受保护的技术使用者:扬州大学技术研发日:技术公布日:2024/8/16
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