一种应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的方法
发布日期:2024-08-22 浏览次数: 专利申请、商标注册、软件著作权、资质办理快速响应热线:4006-054-001 微信:15998557370
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摘要: | 本发明涉及生物医学,具体为一种应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的方法。、口腔鳞状细胞(oral squamous cell carcinoma,oscc)是恶性程度最高的恶性肿瘤之一,同样是最常见的口腔肿瘤类型,口腔鳞状细胞癌患者常常伴有转移、高的复发率以及差的预后。流行病学统计分析每年全球... | ||
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本发明涉及生物医学,具体为一种应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的方法。背景技术:1、口腔鳞状细胞(oral squamous cell carcinoma,oscc)是恶性程度最高的恶性肿瘤之一,同样是最常见的口腔肿瘤类型,口腔鳞状细胞癌患者常常伴有转移、高的复发率以及差的预后。流行病学统计分析每年全球大约有10万人死于口腔鳞状细胞癌及其带来的并发症,因此口腔鳞状细胞癌给整个社会医疗保障体系带来了巨大的挑战与负担。因为大部分患者在首次接受临床检查时已经是晚期,oscc的5年生存率仍然低于50%。尤其在东南亚地区(包括泰国、印度、孟加拉国等),患者死亡率达到70%左右。目前,oscc的主要治疗方式以手术切除为主,辅以放疗和化疗,但患者的5年生存率并没有明显提高。因此如何实现早期预防、早期诊断、探索oscc的敏感诊断标志物以及有效治疗的个体化治疗方案,提高临床治愈率及生存率是目前备受关注的问题之一。2、铜死亡(cuproptosis)是近年来新发现的一种程序性细胞死亡机制,已成为肿瘤发生、转移和免疫调节的潜在因素。长链非编码rna(long non-coding rna,lncrna)已被文献报道具有多种在癌症中的调控作用,并有望成为生物标志物。然而,铜死亡相关lncrna(crl)在口腔鳞状细胞癌中的作用和预后意义仍然知之甚少。3、因而需要对铜死亡相关基因的标记物进行快速准确地进行分析,应用合适的标记物对oscc进行有效评价,从而提升患者的治愈率。技术实现思路1、本发明的目的在于提供一种应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的方法,以解决上述背景技术中提出的问题。2、本发明提供一种应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的方法,包括:3、s1、获取m个预后样本,对各所述预后样本进行标记物采集,每个所述预后样本提取n个标记物;4、s2、根据n个所述标记物的含量按照从高到低进行排序,得到所述标记物序列;5、s3、应用训练好的cox模型得到各所述预后样本的预测存活时间,根据所述预测存活时间对所述标记物序列进行数据筛选;6、当所述预测存活时间小于存活阈值时,以所述标记物序列中的首值对应的标记物作为目标标记物;7、当所述预测存活时间大于或等于所述存活阈值时,则应用主成分分析法对影响所述预测存活时间的标记物进行分析,得到目标标记物;8、s4、以所述目标标记物作为口腔鳞癌危险程度评价指标。9、在本发明中,利用cox等模型对预后样本的存活时间进行模拟推演,并在存活时间大于预设的存活阈值时利用主成分分析法对数据进行筛选,结合cox模型和主成分分析法的优点,可以有效地锁定对口腔鳞癌危险程度进行评价的目标标记物。10、在一个可能的实施方式中,所述步骤s4之后,还包括,11、对所述预后样本对应的生物检材进行培养,得到实验样本,监测所述实验样本中的细胞增殖速度,若敲减所述目标标记物后的细胞增殖速度小于敲减其他标记物后的细胞增殖速度,则以所述目标标记物作为口腔鳞癌危险程度评价指标,否则以增殖速度最慢的细胞所敲减的标记物作为口腔鳞癌危险程度评价指标,并对所述cox模型进行修正。12、在一个可能的实施方式中,所述步骤s4包括,将所述生物检材置于多孔细胞培养板中,将所述多孔细胞培养板放入培养箱内进行培养,等时间间隔从所述多孔细胞培养板上进行取样,得到包含多个子样本的待评预后样本。13、采用等时间间隔的方式,可以准确地反映标记物转染后对细胞增殖速度的影响,如果采用非等时间间隔的方式进行取样,则无法真实地反映标记物对细胞增殖的抑制作用。14、在一个可能的实施方式中,将所述预后样本中的年龄作为数值变量,性别和分级作为类别变量输入所述cox模型进行分析,得到所述预测存活时间。15、在一个可能的实施方式中,所述步骤s3中还包括,将所述标记物序列进行聚类,得到高危子序列和低危子序列,所述高危子序列中的首值对应的标记物作为所述目标标记物,所述低危子序列应用所述主成分分析法得到所述目标标记物。16、其中,高危子序列中的数据对应的预测存活时间均小于存活阈值,低危子序列中的数据对应的预测存活时间均大于或者等于所述存活阈值。17、可选地,所述聚类采用基于密度的聚类算法。具体地,分别获取各所述标记物的浓度值,依据所述浓度值进行聚类。或者可以采用k-mean聚类算法。18、一种应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的系统,包括,19、数据采集模块,用于获取m个预后样本,对m个所述预后样本进行标记物采集,得到所述预后样本提取n个标记物;20、数据处理模块,用于将n个所述标记物的含量按照从高到低进行排序,得到所述标记物序列,应用所述预后样本的预测存活时间对所述标记物序列进行数据筛选,得到备选标记物;21、数据分析模块,用于对所述备选标记物的检测数据进行分析,得到目标标记物。22、本发明的另一目的在于提供一种存储在计算机可读介质上的计算机程序产品,包括计算机可读程序,供于电子装置上执行时,提供用户输入接口以应用所述应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的系统。23、本发明的另一目的在于提供一种信息数据处理终端,所述信息数据处理终端用于实现所述的应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的系统。24、与现有技术相比,本发明的有益效果是:25、1、采用一种标记物即可对口腔鳞癌危险程度进行有效评价,不再需要多种标记物进行综合分析;26、2、将cox模型和主成分分析法进行结合,快速准确地获得影响口腔鳞癌危险程度的关键标记物;27、3、利用细胞培养得到的增殖结果对标记物的准确性进行评价,避免了对cox模型进行改进或训练,节约了开发成本。技术特征:1.一种应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的方法,包括:2.根据权利要求1所述的应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的方法,其特征在于,所述步骤s4之后,还包括,3.根据权利要求2所述的应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的方法,其特征在于,4.根据权利要求1所述的应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的方法,其特征在于,5.根据权利要求1所述的应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的方法,其特征在于,6.根据权利要求4所述的应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的方法,其特征在于,7.一种应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的系统,其特征在于,包括:8.一种存储在计算机可读介质上的计算机程序产品,包括计算机可读程序,供于电子装置上执行时,提供用户输入接口以应用如权利要求1-7任一项所述的应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的系统。9.一种信息数据处理终端,其特征在于,所述信息数据处理终端用于实现如权利要求1~7任意一项所述的应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的系统。技术总结本发明涉及一种应用标记物评价口腔鳞癌危险程度的方法包括:获取M个预后样本,对各所述预后样本进行标记物采集,每个所述预后样本提取N个标记物;根据N个所述标记物的含量按照从高到低进行排序,得到所述标记物序列;应用训练好的COX模型得到各所述预后样本的预测存活时间,根据所述预测存活时间对所述标记物序列进行数据筛选,得到目标标记物;以所述目标标记物作为口腔鳞癌危险程度评价指标。采用一种标记物即可对口腔鳞癌危险程度进行有效评价。技术研发人员:刘兆龙,邓智元,罗莹,崔一腾,张隽旖,唐湘哲受保护的技术使用者:中南大学技术研发日:技术公布日:2024/8/15